评分:3 更新时间:2019-06-24 大小:24.76 MB 平台:Win8,Win7,WinXP,Win2003,Win2000 语言:简体中文 授权:免费软件介绍
Arlequin是专业的人类遗传学数据分析软件，为从事医学、生物学研究的学者设计，拥有可进行AMOVA计算、中性检验、错配分布等功能，例如：大量的分子序列数据和传统的等基因频率，并提供了很多的方法和统计学检验，能够满足用户多种遗传学分析方便的需求。
功能说明
1、Molecular diversity（分子多态性）
2、Mismatch distribution（错配分布）
3、Haplotype frequency estimation（单倍型频率估计）
4、Linkage disequilibrium（连锁不平衡：检测不同位点上等位基因的非随机关联）
5、Hardy-Weinberg equilibrium（哈温—伯格平衡）
6、Tajima`s neutrality test（Tajima中性检验）
7、Fu`s neutrality test（Fu中性检验）
8、Ewens-watterson neutrality test（Ewens-watterson中性检验）
以上三个中性检验都是基于无限位点模型，适用于DNA sequence 和 RFLP单倍型。
9、Chakraborty`s amalgamation test （Chakraborty`s 融合检验，检测人群的均一性或同质性和中性选择等）
10、Minimu Spanning Network（MSN，最小扩张树或称之为最小支撑树，，基于分子差异）
11、AMOVA 分子差异度分析，用以评测人群的遗传结构
12、Pairwise genetic distances （遗传距离的估计）
13、Exact test of population differentiation （检测随机交配群体单倍型的非随机分布）
14、Assignment test of genotype （通过估计等位基因频率将单个基因型分配到特定的人群中）
软件官网
Arlequin 的官方网址是：https://cmpg.unibe.ch/software/arlequin35/
软件综述
Arlequin (人类遗传学数据分析软件) 是一个流行的软件包，用于分析人类遗传学数据。它具有许多功能，包括：
- 人口遗传学分析：Arlequin可以用于分析人口遗传学数据，例如等位基因频率、等位基因多样性、连锁不平衡和分化。
- 分子进化分析：Arlequin可以用于分析分子进化数据，例如核苷酸序列和氨基酸序列。
- 种系重建：Arlequin可以用于重建种系，例如系统发育树和网络。
- 模拟：Arlequin可以用于模拟遗传数据，例如人口遗传数据和分子进化数据。
Arlequin 是一款功能强大的软件包，适用于各种人类遗传学研究。它易于使用，并且具有详细的文档。它还得到了活跃的开发团队的支持，他们不断添加新功能和改进软件。
Arlequin 的一些优势包括：
- 易于使用：Arlequin具有直观的图形用户界面，即使是初学者也可以轻松使用。
- 功能强大：Arlequin具有许多功能，适用于各种人类遗传学研究。
- 准确性：Arlequin 使用经过验证的算法来分析数据，确保结果准确可靠。
- 支持多种数据类型：Arlequin支持多种数据类型，包括基因型数据、序列数据和群体数据。
- 开源：Arlequin是开源软件，这意味着它可以免费使用和修改。
Arlequin 的一些缺点包括：
- 计算量大：Arlequin在分析大型数据集时可能会很慢。
- 内存消耗大：Arlequin在分析大型数据集时可能会消耗大量内存。
- 缺乏一些高级功能：Arlequin缺乏一些高级功能，例如基因富集分析和通路分析。
总体而言，Arlequin是一款功能强大、易于使用的人类遗传学数据分析软件。它适用于各种研究，并且得到了活跃的开发团队的支持。
