评分:3 更新时间:2022-02-07 大小:225.24 MB 平台:WinAll、Win10、Win7、WinXP 语言:简体中文 授权:免费软件介绍
Geneious是专为分子生物学家和生物化学家设计的一款软件，提供便捷的梯形拟合和峰值调用功能，帮助用户快速生成基因型微卫星位点和等位基因列表。软件支持序列对比和系统学分析、毗连群、引物设计和克隆和限制性分析等。
主要功能
1、NGS分析和基因组学
使用行业领先的算法，包括TopHat和Velvet，Illumina、PacBio或Torrent读数（任何长度、成对端、条形码）的从头组装或参考映射。对数据的综合分析，包括基因组浏览器、持续的可视化、SNP调用和RNA-Seq表达式分析。
2、序列图和色谱分析
修剪、组装和查看Sanger排序跟踪文件，正确的碱基调用并创建一致的序列。基因预测、模式、翻译和变异调用的自动标注。基因型微卫星跟踪自动梯拟合和峰值调用和生成等位基因表。
3、对齐和树构建
使用包括MAFFT和ClustalW在内的可信算法对DNA或蛋白质进行成对和多种比对。查看和编辑实时翻译和突出显示。使用包括RAxML和PAUP在内的同行评审算法构建系统树，并为公开准备的图形调整显示设置。
4、分子克隆
查看质粒图，自动注释矢量并用注释复制粘贴序列。寻找限制站点、消化、连接和执行Golden Gate，Gibson和Gateway克隆。设计引物，找到CRISPR站点并优化密码。在克隆过程中跟踪历史和亲子后代谱系。
5、搜索、共享和自动化
针对NCBI进行批量BLAST，并直接搜索GenBank。使用无缝集成的共享库集中和协作数据。导入和导出大多数行业标准文件格式。建立自动化的工作流程，以提高效率，控制业务流程，并减少您的研究中的人为错误。
6、SnapGene文件导出
将SnapGene*.dna序列文件拖放到Geneious中，无缝地导入序列及其注释和其他元数据。
7、CRISPR-CPF1特异性评分
自信地选择最佳CRISPR-CPF1引导RNA位点使用新的特异性评分，这是根据对您选择的数据库的非目标分析计算出来的。
8、智能NGS导入
只需一个简单的步骤就可以将任何类型的SAM、BAM、GFF、BED和VCF文件拖放到Geneious中，即使您有不同的样品和参考序列的混合物。
9、CRISPR Cpf1选项
添加了CRISPR-CPF1与5’PAM位点的支持。在A和T丰富序列中找到位点，并在体内具有更高的裂解效率。
10、RNA-Seq表达分析的火山图
在交互式火山图中可视化基因表达，可以用来突出和跳转到差异表达基因。
常见问题
如何卸载Geneious软件？
方法一：打开电脑控制面板》》程序》》程序和功能，在程序和功能面板中找到Geneious软件，右键点击卸载即可。
方法二：安装并打开电脑管家软件，选择进入软件管理选项，点击卸载选项，在列表中找到Geneious软件，点击卸载即可。
方法三：安装并打开360软件管家，在卸载选项的列表中找到Geneious软件，点击卸载即可。
软件官网
软件综述
Geneious Prime™ 是一款强大的分子生物学软件，用于 DNA 和蛋白质序列分析、编辑和可视化。它具有许多高级功能，包括：
- 序列编辑器： 一个直观的序列编辑器，允许您轻松地输入、编辑和分析序列。
- 序列比对： 一种用于比较两个或多个序列的算法，以发现它们的相似性和差异。
- 序列注释： 一种将信息添加到序列的方法，例如基因名称、功能和变异。
- 序列搜索： 一种在基因数据库中搜索序列的方法，以查找相似或相关的序列。
- 蛋白质结构预测： 一种基于蛋白质序列预测蛋白质结构的方法。
- 分子进化分析： 一种研究分子如何随时间变化的方法。
- 基因组组装： 一种将多个短序列组合成单个完整基因组的方法。
- RNA-Seq分析： 一种分析RNA-Seq数据的算法，以研究基因表达。
- NGS数据分析： 一种分析NGS数据的方法，以研究基因组变异、基因表达和蛋白质结构。
- NGS预处理数据分析： 一种分析NGS预处理数据的方法，以研究基因定量、基因注释和基因分类。
- NGS引物设计： 一种根据基因组序列设计引物的算法，以用于PCR和qPCR实验。
Geneious Prime™ 是一款功能强大的软件，可用于各种分子生物学研究。它易于使用，具有直观的界面，并具有广泛的功能。它是一款非常适合生物学家和研究人员的工具。
Geneious Prime™ 是一款商业软件，但它提供免费试用版。您可以从 Geneious 网站下载试用版。
